ترعى مؤسسة أبو العينين للنشاط الخيري، مشروعات محو الأمية، وذلك منذ تأسيسها، مما دفع منظمة اليونسكو لاختيارها راعيًا رسما لمحو الأمية.
وقامت المؤسسة بإنشاء أول فصلين لمحو الأمية منذ عام 2001، ووصل عدد الفصول إلى 72 فصلا على مستوى حي جنوب الجيزة، وفي عام 2006 تم توقيع بروتوكول بين المؤسسة والهيئة العامة لمحو الأمية وتعليم الكبار، ثم وقعت بروتوكولا مع محافظة الجيزة عام 2009.
وتعتبر المؤسسة أول من طبق نظام محو الأمية بأجهزة الحاسب الآلى، كما أطلقت مبادرة “جيزة بلا أمية”.